Thomas Müller (d. 13 Eylül 1989; Weilheim, Batı Almanya), hücuma yönelik orta saha ve forvet pozisyonlarında oynayan Alman millî futbolcudur.

Bayern Münih

Müller, profesyonel futbol kariyerine Bayern Münih ile başladı.
Müller, 2008-09 sezonunda 4 maça çıktı ve hiç gol kaydedemedi. Bayern Münih forması ilk kez 15 Ağustos 2008 tarihinde, Hamburg maçında giydi. Maç 2-2 beraberlik ile sonuçlandı. UEFA Şampiyonlar Ligi'nde Müller ilk maçına 10 Mart 2009 tarihinde, Sporting karşısında çıktı. Maç 7-1 galibiyet ile sonuçlandı. UEFA Şampiyonlar Ligi'ndeki ilk golünü de bu maçta kaydetti. DFB-Pokal'da Müller ilk maçına 10 Ağustos 2008 tarihinde, Weiß Erfurt karşısında çıktı. Maç 4-3 galibiyet ile sonuçlandı.
Müller, 2009-10 sezonunda 34 maça çıktı ve 13 gol kaydetti. Müller kariyerinin ilk hat-trick'ini 1 Mayıs 2010 tarihinde, Bochum ile yapılan maçta 3 gol atarak yaptı. Maç 3-1 Bayern Münih galibiyeti ile bitti.
22 Mayıs 2010 tarihinde, Bayern Münih UEFA Şampiyonlar Ligi'nde Inter ile finale kaldı. Müller bu maçta 90 dakika görev aldı. Maç 2-0 Inter galibiyeti ile bitti ve UEFA Şampiyonlar Ligi'ni Inter kazanmış oldu.
15 Mayıs 2010 tarihinde, Bayern Münih DFB-Pokal'da Werder Bremen ile finale kaldı. Müller bu maçta 75 dakika görev aldı. Maç 4-0 Bayern Münih galibiyeti ile bitti ve DFB-Pokal'ı Bayern Münih kazanmış oldu.
Müller, 2010-11 sezonunda 34 maça çıktı ve 12 gol kaydetti. 30 Nisan 2011 tarihinde, Schalke 04 ile yapılan maçta Müller 2 gol kaydederek başarılı performansını sürdürdü.
7 Ağustos 2010 tarihinde, Bayern Münih DFL-Supercup'ta Schalke 04 ile finale kaldı. Müller bu maçta 90 dakika görev aldı ve bir gol kaydetti. Maç 2-0 Bayern Münih galibiyeti ile bitti ve DFL-SuperCup'ı Bayern Münih kazanmış oldu.
Müller, 2011-12 sezonunda 34 maça çıktı ve 7 gol kaydetti. 5 Mayıs 2012 tarihinde, Köln ile yapılan maçta Müller 2 gol kaydederek başarılı performansını sürdürdü.
19 Mayıs 2012 tarihinde, Bayern Münih UEFA Şampiyonlar Ligi'nde Chelsea ile finale kaldı. Müller bu maçta 85 dakika görev aldı ve bir gol kaydetti. Maç 5-4 Chelsea galibiyeti ile bitti ve UEFA Şampiyonlar Ligi'ni Chelsea kazanmış oldu.
12 Mayıs 2012 tarihinde, Bayern Münih DFB-Pokal'da Dortmund ile finale kaldı. Müller bu maçta 45 dakika görev aldı. Maç 5-2 Dortmund galibiyeti ile bitti ve DFB-Pokal'ı Dortmund kazanmış oldu.
Müller, 2012-13 sezonunda 28 maça çıktı ve 13 gol kaydetti. Stuttgart ve Düsseldorf ile yapılan maçlarda Müller maç başına 2 gol kaydederek başarılı performansını sürdürdü.
25 Mayıs 2013 tarihinde, Bayern Münih UEFA Şampiyonlar Ligi'nde Dortmund ile finale kaldı. Müller bu maçta 90 dakika görev aldı. Maç 2-1 Bayern Münih galibiyeti ile bitti ve UEFA Şampiyonlar Ligi'ni Bayern Münih kazanmış oldu.
1 Haziran 2013 tarihinde, Bayern Münih DFB-Pokal'da Stuttgart ile finale kaldı. Müller bu maçta 90 dakika görev aldı ve bir gol kaydetti. Maç 3-2 Bayern Münih galibiyeti ile bitti ve DFB-Pokal'ı Bayern Münih kazanmış oldu.
12 Ağustos 2012 tarihinde, Bayern Münih DFL-Supercup'ta Dortmund ile finale kaldı. Müller bu maçta 90 dakika görev aldı ve bir gol kaydetti. Maç 2-1 Bayern Münih galibiyeti ile bitti ve DFL-SuperCup'ı Bayern Münih kazanmış oldu.
2024-25 sezonunun sonunda Bayern Münih'ten ayrılacağını duyuran Thomas Müller, son sezonunda Bundesliga şampiyonluğu yaşayarak 2025 FIFA Kulüpler Dünya Kupası'ndan sonra kulübüne veda etti.

Almanya U-21

Almanya U-21 ile ilk maçına 13 Kasım 2009 tarihinde, Kuzey İrlanda U-21 maçına çıktı. Maç 1-1 beraberlik ile sonuçlandı. Almanya U-21 adına ilk golünü ise 17 Kasım 2009 tarihinde, San Marino U-21 ile yapılan maçta kaydetti. Maç 11-0 galibiyet ile sonuçlandı.