Thomas Linke (d. 26 Aralık 1969, Sömmerda), defans pozisyonunda görev yapmış Alman millî futbolcudur.
Profesyonel kariyerine 1988 yılında Rot-Weiß Erfurt kulübünde başladı. Daha sonra sırasıyla Schalke 04, Bayern Munich, Red Bull Salzburg ve Bayern Munich II kulüplerinde oynadı.