Otto Stern (17 Şubat 1888 - 17 Ağustos 1969), Alman fizikçidir.
Alman İmparatorluğu'na ait Prusya Krallığı sınırlarındaki Sorau (Żary) de doğmuştur (şu an Polonya topraklarında). Eğitimini University of Breslauda tamamlamış ve fiziksel kimya dalında doktora yapmıştır. Rostock Üniversitesinde profesör olarak çalışmıştır. 1923 yılında Institut für Physikalische Chemie adlı yeni bir bölümde çalışmak üzere Hamburg Üniversitesine geçmiştir.
Nazi dönemi nedeniyle Carnegie Institute of Technologye geçmiş ve akabinde University of California, Berkeleyde çalışmalarına devam etmiştir.
Stern deneysel fizikçiydi. Molecular Ray Methodun geliştirilmesi için çalışmıştır. Atomik manyetik hareket ölçümleri, atom ve moleküllerin doğal hareketlerinin demonstre edilmesi, protonun manyetik hareketinin keşfi diğer çalışma konularıydı. Bundan dolayı 1943 yılında Nobel Fizik Ödülü'ne layık görülmüştür.