Milonja Dukić (d. 12 Aralık 1965, Ivangrad, Yugoslavya SFC) Karadağlı, Sırp eski futbolcudur.
Dukić, Yugoslavya Ligi takımlarından Partizan'da forma giydi. Ayrıca Olimpija Ljubljana'da oynadı. 1990 yılında, Süper Lig ekiplerinden Trabzonspor'a transfer oldu. Daha sonra Primeira Liga ekiplerinden Farense'ye transfer oldu ve burada 7 sezon forma girdi.