Rolf Martin Zinkernagel (d. 6 Ocak 1944, Riehen, Basel-Stadt, İsviçre), İsviçreli immünolog. Zürih Üniversitesi'nde immunoloji profesörü olarak çalışmaktadır. 1996 yılında Avustralyalı Peter C. Doherty ile birlikte bağışıklık sistemi ile ilgili çalışmaları nedeniyle Nobel Fizyoloji veya Tıp Ödülü'nü kazanmıştır.